1. 沼氣細菌分解有機物，產生沼氣的過程，叫沼氣發酵。沼氣發酵微生物是一個統稱，包括發酵性細菌、產氫產乙酸菌、耗氫產乙酸菌、食氫產甲烷菌、食乙酸產甲烷菌五大類群。五大類群細菌構成一條食物鏈。前三類群細菌的活動可使有機物形成各種有機酸，因此，將其統稱為不產甲烷菌；后二類群細菌的活動可使各種有機酸轉化成甲烷，因此，將其統稱為產甲烷菌。

2. 不產甲烷菌

不產甲烷菌能將復雜的大分子有機物變成簡單的小分子量的物質。它們的種類繁多，根據作用基質來分，有纖維分解菌、半纖維分解菌、淀粉分解菌、蛋白質分解菌、脂肪分解菌和一些特殊的細菌，如產氫菌、產乙酸菌等。

產甲烷菌

產甲烷菌是沼氣發酵的主要成分——甲烷的產生者。是沼氣發酵微生物的核心，它們嚴格厭氧，對氧和氧化劑非常敏感，最適宜的pH值范圍為中性或微堿性。它們依靠二氧化碳和氫生長，并以廢物的形式排出甲烷，是要求生長物質最簡單的微生物。