檢測認證人脈交流通訊錄
- DAP-seq:轉錄因子結合位點研究新方法(DNA親和純化測序)
在功能基因組學和表觀遺傳學研究中,轉錄因子結合位點(TFBS)的發掘一直是研究熱點。傳統的ChIP-seq(染色質免疫共沉淀測序)方法,在抗體質量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而,好的抗體可遇不可求,這限制了ChIP-seq更廣泛的應用。
DAP-seq技術的出現,使TFBS 的研究不再局限于物種,不再受抗體質量的限制,為生命科學領域轉錄因子的研究提供了新的有效工具。
DAP-seq具有與ChIP-seq同樣的功能。通過體外蛋白表達技術,表達出帶有標簽的轉錄因子,和基因組DNA文庫在體外進行結合,然后分離出所有與轉錄因子結合的DNA,再使用高通量測序,找到轉錄因子的結合位點。
1、 凝膠阻滯實驗(EMSA):DAP-seq后續驗證服務。
2、 酵母單雜交:DAP-seq后續驗證服務
3、 ChIP-seq:高效檢測重組蛋白、轉錄因子在基因組的結合位點
4、 DAP-seq與RNA-seq聯合分析: 分析轉錄因子的靶基因在RNA-seq數據中的表達變化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數據,增加轉錄組測序的分析深度。
5、 DNA-pull down:鑒定與DNA結合的蛋白。
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